Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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