Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxa7P02830 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxa7P02830 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa7P02830 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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