Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01649 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms