Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms