Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lnx1O70263 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms