Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms