Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DffaO54786 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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