Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CrxO54751 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CrxO54751 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CrxO54751 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms