Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms