Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NudcO35685 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NudcO35685 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NudcO35685 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NudcO35685 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms