Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Clk2O35491 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clk2O35491 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms