Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Kcnk3O35111 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Kcnk3O35111 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms