Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckarO08786 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckarO08786 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckarO08786 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckarO08786 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckarO08786 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckarO08786 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckarO08786 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckarO08786 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckarO08786 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms