Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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MsmbO08540 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MsmbO08540 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MsmbO08540 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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