Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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