Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20828J3KMI7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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