Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms