Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colca2F8VPY8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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