Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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