Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ankrd50F7BE84 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ankrd50F7BE84 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ankrd50F7BE84 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ankrd50F7BE84 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ankrd50F7BE84 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ankrd50F7BE84 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd50F7BE84 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms