Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3298E9PW80 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms