Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms