Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms