Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ssxb8B1AY40 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ssxb8B1AY40 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ssxb8B1AY40 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ssxb8B1AY40 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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