Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms