Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms