Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SetxA2AKX3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms