Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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