Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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