Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek4Q9Z1J2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek4Q9Z1J2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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