Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr54Q9R0D8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr54Q9R0D8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms