Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nek3Q9R0A5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms