Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gpc6Q9R087 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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