Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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