Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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