Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gde1Q9JL56 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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