Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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