Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms