Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms