Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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