Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp29Q9ES63 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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