Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms