Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms