Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Stx12Q9ER00 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms