Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp7Q9EPC5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms