Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms