Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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