Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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