Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms