Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Tmem54Q9D7S1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tmem54Q9D7S1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem54Q9D7S1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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